Durante la temporada 2009/10 quedó en la 1.ª posición de la Primera Nacional «A» y jugó, posteriormente, el play-off de ascenso contra el filial del F. C. Barcelona; siendo eliminado en su intento de conseguir el ascenso a la División de Plata. Con el primer título de campeón de América en sus manos, Independiente accedió a disputar por primera vez la Copa Intercontinental, que definía al mejor equipo del mundo contra el campeón de Europa.
